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    "title": "L\u2019IA ne comprend pas encore tout des prot\u00e9ines",
    "modified_at": "2025-05-22 09:55:18",
    "published_at": "2025-05-22 10:53:00",
    "url": "https://press.vub.ac.be/lia-ne-comprend-pas-encore-tout-des-proteines",
    "short_url": "http://prez.ly/YXld",
    "culture": "fr_BE",
    "language": "FR",
    "subtitle": "Ce qu\u2019une prot\u00e9ine sanguine nous apprend sur les limites de l\u2019intelligence artificielle",
    "slug": "lia-ne-comprend-pas-encore-tout-des-proteines",
    "body": "<p>Des chercheurs de la Vrije Universiteit Brussel, de l&rsquo;Institut Interuniversitaire de Bioinformatique de Bruxelles et de l&rsquo;Universit&eacute; de Gand ont d&eacute;couvert qu&rsquo;une prot&eacute;ine importante pr&eacute;sente dans notre sang, l&rsquo;alpha-1-glycoprot&eacute;ine acide (AGP), se comporte de mani&egrave;re bien plus complexe que ce que l&rsquo;intelligence artificielle (IA) peut actuellement pr&eacute;dire.</p><p>L&rsquo;AGP est abondante dans notre sang et joue un r&ocirc;le cl&eacute; dans les inflammations et certains cancers. Elle influence &eacute;galement la mani&egrave;re dont les m&eacute;dicaments agissent dans notre corps. Pourtant, malgr&eacute; des d&eacute;cennies de recherches, cette prot&eacute;ine reste difficile &agrave; comprendre. En cause : sa structure complexe, d&eacute;cor&eacute;e de mol&eacute;cules de sucre appel&eacute;es &laquo; glycanes &raquo;, qui changent constamment de forme et rendent son comportement tr&egrave;s variable.</p><p>Dr. Bhawna Dixit a &eacute;tudi&eacute; l&rsquo;AGP dans le cadre de sa th&egrave;se de doctorat. Elle a d&eacute;couvert que de petites mutations g&eacute;n&eacute;tiques dans l&rsquo;AGP &ndash; certaines &eacute;tant pr&eacute;sentes chez des patients atteints de cancer &ndash; peuvent totalement modifier la fa&ccedil;on dont la prot&eacute;ine bouge et interagit avec les m&eacute;dicaments. Et lorsque l&rsquo;on prend aussi en compte les glycanes, qui varient selon l&rsquo;&eacute;tat de sant&eacute; ou d&rsquo;inflammation du corps, les choses deviennent encore plus complexes.</p><blockquote><br>\u200b&laquo; Un minuscule changement au bon endroit peut compl&egrave;tement modifier le comportement de la prot&eacute;ine &raquo;, explique la Dre Dixit. &laquo; Cela a des cons&eacute;quences importantes pour la m&eacute;decine personnalis&eacute;e, car tout le monde ne r&eacute;agit pas de la m&ecirc;me mani&egrave;re. &raquo;<br>\u200b</blockquote><p>Dans une &eacute;tude compl&eacute;mentaire, les chercheurs ont test&eacute; si AlphaFold, une IA c&eacute;l&egrave;bre pour pr&eacute;dire les structures de prot&eacute;ines, pouvait mod&eacute;liser ces changements complexes. Malheureusement, non. AlphaFold s&rsquo;en sort bien avec les parties rigides des prot&eacute;ines, mais a du mal &agrave; repr&eacute;senter correctement les zones flexibles et dynamiques. Des comparaisons avec des donn&eacute;es exp&eacute;rimentales ont montr&eacute; que l&rsquo;IA simplifie trop ces r&eacute;gions mobiles.</p><blockquote><br>\u200b&laquo; Les mod&egrave;les d&rsquo;IA comme AlphaFold sont form&eacute;s sur des repr&eacute;sentations statiques des prot&eacute;ines &raquo;, explique Dixit. &laquo; Mais beaucoup de prot&eacute;ines sont tout sauf statiques. Il faut donc &ecirc;tre prudent avec les pr&eacute;dictions de l&rsquo;IA. &raquo;<br>\u200b</blockquote><p>Ces r&eacute;sultats montrent que, m&ecirc;me si l&rsquo;IA a un grand potentiel, elle ne saisit pas encore tout &ndash; surtout quand il s&rsquo;agit des processus biologiques complexes de notre corps. L&rsquo;exp&eacute;rimentation en laboratoire reste donc essentielle. La collaboration entre les humains et l&rsquo;intelligence artificielle n&rsquo;a jamais &eacute;t&eacute; aussi importante.</p><p>Vous pouvez explorer les r&eacute;sultats comparatifs sur le site interactif : <a href=\"https://bio2byte.be/af_nmr_nma\">https://bio2byte.be/af_nmr_nma</a></p><p>&nbsp;</p><p><strong>Referenties:</strong></p><ul class=\"release-content-list release-content-list--bulleted release-content-list--align-inherit\"><li><span>Dixit, B., Vranken, W., &amp; Ghysels, A. (2023). <em>Conformational dynamics of &alpha;\u20101 acid glycoprotein (AGP) in cancer</em>. <a href=\"https://doi.org/10.1002/prot.26607\">DOI</a></span></li><li><span>Gavalda-Garcia, J., Dixit, B., D&iacute;az, A., Ghysels, A., &amp; Vranken, W. (2024). <em>Gradations in protein dynamics captured by experimental NMR are not well represented by AlphaFold2 models</em>. <a href=\"https://doi.org/10.1016/j.jmb.2024.168900\">DOI</a></span></li></ul><hr /><p><strong>Contacte:</strong></p><p>Bhawna Dixit: Bhawna.dixit@vub.be</p><div class=\"release-content-contact\" id=\"contact-dcfb2451-3cd8-4bc2-8847-b4ba5c9166ea\">\n    <div class=\"release-content-contact__avatar\"><img src=\"https://cdn.uc.assets.prezly.com/96e3692f-39a4-433b-b0ee-9008befa578f/-/crop/1117x1118/419,0/-/preview/-/scale_crop/128x128/center/-/format/auto/\" alt=\"Koen Stein\" class=\"release-content-contact__avatar-image\" /></div>\n    <div class=\"release-content-contact__details\">\n        <strong class=\"release-content-contact__name\">Koen Stein</strong>\n        <em class=\"release-content-contact__description\">Perscontact wetenschap &amp; onderzoek</em>\n        <ul class=\"release-content-contact__details-list\"><li class=\"release-content-contact__details-list-item\"><a href=\"mailto:koen.stein@vub.be\"  class=\"release-content-contact__details-list-item-link\" title=\"koen.stein@vub.be\"><svg class=\"icon icon-paper-plane release-content-contact__details-list-item-icon\">\n                <use xlink:href=\"#icon-paper-plane\"></use>\n            </svg>koen.stein@vub.be</a></li>\n<li class=\"release-content-contact__details-list-item\"><a href=\"tel:+32 (0)471517909\"  class=\"release-content-contact__details-list-item-link\" title=\"+32 (0)471517909\"><svg class=\"icon icon-mobile release-content-contact__details-list-item-icon\">\n                <use xlink:href=\"#icon-mobile\"></use>\n            </svg>+32 (0)471517909</a></li>\n<li class=\"release-content-contact__details-list-item\"><a href=\"https://vub.be\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\" class=\"release-content-contact__details-list-item-link\" title=\"vub.be\"><svg class=\"icon icon-browser release-content-contact__details-list-item-icon\">\n                <use xlink:href=\"#icon-browser\"></use>\n            </svg>vub.be</a></li></ul>\n    </div>\n</div><p>&nbsp;</p><p>&nbsp;</p><p>&nbsp;</p>",
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